有了這個新技術(shù)，胃癌檢測告別胃鏡、鋇餐
胃鏡和鋇餐是目前檢測胃癌最常用的兩種方法。相對于這兩種方法，DNA甲基化檢測方法的一大特點(diǎn)就是無創(chuàng)，既不用“插管”，也不用“拍片”，并且其最大的優(yōu)勢還在于，可以一次性完成多個癌種的篩查，大大提高了篩查效率。
胃癌由于早期不容易被發(fā)現(xiàn)，導(dǎo)致死亡率較高。定期進(jìn)行篩查，及早發(fā)現(xiàn)及早治療，是對付胃癌的最佳思路。然而，胃鏡篩查對很多人來說是“受罪”的體檢項(xiàng)目，目前應(yīng)用的血清腫瘤標(biāo)志物(如癌胚抗原)靈敏度又很低，這些問題該怎么解決？
“DNA甲基化測癌”或?qū)⒊蔀橐粋€新的解決方案。北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心、北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心湯富酬、文路團(tuán)隊與北京大學(xué)第三醫(yī)院普外科付衛(wèi)團(tuán)隊合作，通過對血漿游離DNA中癌癥甲基化標(biāo)志物進(jìn)行測序分析，實(shí)現(xiàn)了胃癌早期無創(chuàng)檢測及胃癌、結(jié)直腸癌和肝癌無創(chuàng)早期鑒別檢測。該成果近期發(fā)表在國際學(xué)術(shù)刊物《臨床化學(xué)》雜志上。
胃癌甲基化標(biāo)志物特異性接近100%
作為文章通訊作者之一，文路副研究員向科技日報記者介紹，2015年，科研人員基于人類基因組中CpG短串聯(lián)序列的分布特征，研發(fā)了一種新技術(shù)MCTA-Seq，采用單條靶向引物捕獲近9000個CpG短串聯(lián)序列的甲基化信息，并將該技術(shù)用于肝細(xì)胞癌無創(chuàng)檢測；2019年，科研人員又將該技術(shù)應(yīng)用于結(jié)直腸癌早期無創(chuàng)檢測；在2021年發(fā)表的論文當(dāng)中，科研人員將該技術(shù)進(jìn)一步應(yīng)用于胃癌早期無創(chuàng)檢測和三種消化道癌癥的無創(chuàng)鑒別檢測。
在此研究中，科研人員識別出了一組區(qū)分胃癌與正常胃黏膜的甲基化標(biāo)志物，以及另一組區(qū)分胃癌、結(jié)直腸癌和肝癌的甲基化標(biāo)志物。利用這些標(biāo)志物，科研人員建立了檢測與鑒別以上3個癌種的分類器。該分類器檢測胃癌、結(jié)直腸癌和肝癌的靈敏度分別為56%、78%和85%，鑒別3個癌種的準(zhǔn)確度分別為94%、80%和68%，特異性接近100%。
“但從目前的樣本量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果出發(fā)，這項(xiàng)技術(shù)離臨床應(yīng)用還有大概5年的距離。”文路解釋，“全球范圍有許多同行都在這個方向上進(jìn)行探索，以英美的一項(xiàng)研究為例，目前他們得到的檢測效果和我們差不多。但我們的目標(biāo)在于找到最合適的標(biāo)志物，用更簡單的方法和更低廉的成本得到同樣水平的結(jié)果。”
DNA甲基化檢測方法最大優(yōu)勢是無創(chuàng)
胃鏡和鋇餐是目前檢測胃癌最常用的兩種方法。前者需要患者接受麻醉，并將導(dǎo)光管插入患者胃中；后者需要患者服用硫酸鋇乳液，并接受X射線照射。相對這兩種方法，DNA甲基化檢測方法的一大特點(diǎn)就是無創(chuàng)，既不用“插管”，也不用“拍片”。不過，新方法的最大優(yōu)勢還在于，它可以一次性完成多個癌種的篩查，大大提高了篩查效率。在未來的臨床應(yīng)用中，患者可以先通過DNA甲基化方法篩查出可能患有的癌種，再通過該癌種對應(yīng)的專門診斷方法進(jìn)行確認(rèn)。
“MCTA-Seq用于無創(chuàng)腫瘤早篩的前景是很廣闊的。”文路評價說，“我們這次研究只涵蓋3個消化道癌種，但是MCTA-Seq技術(shù)具有篩選與檢測不同癌種的甲基化標(biāo)志物的能力，以肺癌為首的發(fā)病率前十的癌癥，乃至幾十個癌種，將來都有可能覆蓋到。此外，DNA甲基化檢測方法還可以和其他檢測方法結(jié)合，增加靈敏度和準(zhǔn)確性，降低假陽性率。這些都是技術(shù)的未來發(fā)展方向。”
